华大基因自1999年成立以来，坚持"以任务带学科、带产业、带人才"，先后完成了国际人类基因组计划"中国部分"(1%，承担其中绝大部分工作)、国际人类单体型图计划(10%)、水稻基因组计划、家蚕基因组计划、家鸡基因组计划、抗SARS研究、"炎黄一号"(100%)、大熊猫等多项具有国际先进水平的基因组科研工作，在Nature和Science等国际一流的学术杂志上发表多篇论文，奠定了中国基因组科学在国际上的领先地位。同时，建立了大规模测序、生物信息、克隆、健康、农业基因组等技术平台，其测序能力及生物信息分析能力世界领先。

　　华大基因已形成科学、技术、产业相互促进的发展模式，建成一支具有世界一流水平的产学研队伍，开展一系列的重要动植物、人类健康、生物能源等基因组的研究，致力于人类健康服务事业和科技应用领域的发展。

　　在未来发展中，华大基因将依托先进的测序和检测技术、高效的信息分析能力、丰富的生物资源，以多学科结合的新型生物科研体系为基础，致力搭建核酸研究平台、蛋白研究平台、生物信息平台，并作为核心单位参与国家基因库的建立，为全球的科研工作者提供创新型生物研究的科技服务，推动基因组学研究、分子育种、医疗健康、环境能源等领域的科研发展。同时，为广大普通民众提供前沿生物科技在医疗、农业、环境及能源等领域的应用服务，真正做到科技惠民，为我国生物经济产业的战略发展奠定基础。

　　社会责任

　　抗击非典

　　2003年5月，华大基因用十几个小时就测出了SARS病毒序列，96个小时就做出了SARS检测试剂 酶联免疫试剂盒，并向全国防止非典型肺炎指挥部捐赠30万人份的SARS病毒诊断试剂盒。主席胡锦涛同志来到北京华大访问时，对华大基因在期间做 的贡献给予了高度的评价：“想中央之所想，急人民之所急，办抗病之所需”。

　　SARS鉴定及诊断试剂研制工作场景向全国防治非典型肺炎指挥部捐赠 30 万人份的“ SARS 病毒酶联免疫试剂盒”

　　印度洋海啸

　　2004年12月30日，华大基因派出DNA鉴定救援组赶赴泰国海啸灾区，承担了海啸遇难人员DNA检测的任务。当时遇难者数目庞大，鉴定DNA的工作无法实行。华大基因主动提出为泰国遇难者免费鉴定逾千份的DNA样本

　　大规模体检

　　2006年，华大基因为一些偏远地区如西藏、内蒙古等地的少数民族进行了大规模的免费体检。2008年，为盐田区户籍群众做了大规模的免费体检。

　　汶川地震

　　2008年5月18日至6月2日，华大基因地震灾区疾控工作组赴四川灾区参与“5•12汶川地震”灾后重建工作，检测可能引发的突发卫生和传染病事件。2008年5月，华大基因全体员工向汶川地震受灾同胞捐款献爱心。

　　中华骨髓库

　　2010年，华大基因捐助4300万元资金协助中华骨髓库完成9万人份的HLA高分辨分型测序。2011年1月25日，中国红十字会授予深圳华大基因研究院红十字最高荣誉-红十字勋章。